Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmod3Q9JHJ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmod3Q9JHJ0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms