Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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