Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SgshQ9EQ08 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms