Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1dQ9DC28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms