Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms