Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DA42 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DA42 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DA42 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DA42 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms