Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmbim4Q9DA39 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms