Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rexo2Q9D8S4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms