Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc52a2Q9D8F3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc52a2Q9D8F3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms