Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl4Q9D8E6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl4Q9D8E6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms