Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn22Q9D7U6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Cldn22Q9D7U6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn22Q9D7U6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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