Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7G0

Prps1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps1Q9D7G0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prps1Q9D7G0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prps1Q9D7G0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prps1Q9D7G0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms