Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc9bQ9D6E4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttc9bQ9D6E4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms