Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms