Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gcc1Q9D4H2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gcc1Q9D4H2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms