Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syce1Q9D495 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syce1Q9D495 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms