Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933421I07RikQ9D420 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933421I07RikQ9D420 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms