Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rsph14Q9D3W1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms