Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pus10Q9D3U0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms