Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D2Q3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms