Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsig1Q9D2J4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsig1Q9D2J4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms