Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef12Q9D2F1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef12Q9D2F1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms