Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klhdc8bQ9D2D9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhdc8bQ9D2D9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klhdc8bQ9D2D9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms