Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan11Q9D1D1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms