Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Susd3Q9D176 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Susd3Q9D176 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms