Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shmt2Q9CZN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shmt2Q9CZN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms