Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Mrpl55Q9CZ83 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Mrpl55Q9CZ83 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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