Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtpbp8Q9CY28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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