Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snw1Q9CSN1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms