Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CR55 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CR55 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CR55 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CR55 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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