Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd9Q9CR00 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd9Q9CR00 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms