Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CQM1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9CQM1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms