Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prpf8Q99PV0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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