Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rassf3Q99P51 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms