Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b1Q99NB9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b1Q99NB9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms