Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl43Q99N89 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl43Q99N89 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms