Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Brms1Q99N20 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms