Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf17Q99MV7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms