Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1b4Q99ME6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1b4Q99ME6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms