Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TriobpQ99KW3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TriobpQ99KW3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms