Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q99KU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q99KU6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99KU6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99KU6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99KU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99KU6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q99KU6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q99KU6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms