Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lactb2Q99KR3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lactb2Q99KR3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms