Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lims1Q99JW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lims1Q99JW4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms