Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sntg2Q925E0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sntg2Q925E0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms