Protein–RNA interactions for Protein: Q91XT4

Sec16b, Protein transport protein Sec16B, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16bQ91XT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec16bQ91XT4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms