Protein–RNA interactions for Protein: Q91V05

Lce3c, EIG3, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3cQ91V05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Lce3cQ91V05 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms