Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fyco1Q8VDC1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fyco1Q8VDC1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms