Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam20bQ8VCS3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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