Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rdh16f2Q8K3M1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rdh16f2Q8K3M1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rdh16f2Q8K3M1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rdh16f2Q8K3M1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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