Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ssh3Q8K330 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ssh3Q8K330 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssh3Q8K330 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ssh3Q8K330 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssh3Q8K330 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms